薯蓣科薯蓣属包含许多具有重要药用和食用价值的物种资源,对该属植物抗病基因的发掘和利用具有重要意义。NBS-LRR基因是植物抗病基因中最大的一类,在植物对各种病原体的防御反应中发挥重要作用。

  植物多样性与系统演化研究中心孙小芹项目组对已公布基因组数据的几内亚薯蓣(Dioscorea rotundata)中的NBS-LRR基因进行了全基因组鉴定和系统演化分析,共鉴定出167个NBS-LRR基因,其中1个基因属于RNL亚类,其余166个均属于CNL亚类,未检测到TNL亚类基因。并且发现,大部分NBS-LRR基因在染色体上成簇存在,串联重复是影响NBS-LRR基因聚类排列的主要因素。对D. rotundata四种不同组织的转录组分析显示,大部分NBS-LRR基因表达较低,块茎和叶片的NBS-LRR基因表达高于茎和花。本研究提供了D. rotundata基因组中全面的NBS-LRR基因信息,为挖掘针对不同病原菌的功能性NBS-LRR基因奠定了基础。该研究得到国家自然科学基金青年基金项目的资助。

  相关研究进展以题为“Genome-Wide Identification and Evolutionary Analysis of NBS-LRR Genes From Dioscorea rotundata”发表于期刊Frontiers in Genetics,张艳梅副研究员是该论文的第一作者,杭悦宇研究员为通讯作者。

  文章链接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2020.00484/full

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